воскресенье, 13 января 2008 г.

Инструментарий биолога-биохимика

Проходил через дебри толи Sourceforge.net, толи Freshmeat.net и нашел там странный научный opensource-проект. Называется он VigyaanCD. Я заинтересовался и, немного сомневаясь в нужности этого, зашел на сайт VigyaanCD.org. Оказалось очень даже не зря. Я нашел такой инструментарий для биолога, о котором раньше мог только мечтать.

Теперь подробно про этот проект.
Название Vigyaan санскритское слово для обозначени науки и знаний. Проект находится на одном диске в линукс дистрибутиве - Knopix. Скачать его можно с сайта совершенно бесплатно. Не требует установки на компьютер и почти не требователен к системным ресурсам.

Проект содержит программы, о которых написано ниже.

Биоинструменты:
  • программы ДНК секвенаторы;
  • программы для секвенирования и идентификации протеинов;
  • плагины браузеров для просмотра трехмерных структур;
  • приложения из проекта NCBI;
  • приложение для построения филогенетических деревьев;
  • программы для моделирования молекул.

Химинструменты:
  • интерактивные приложения для расчетов молекулярных взаимодействий и квантово-механических вычислений (что это такое я не знаю, но звучит круто);
  • молекулярный просмотрщик;
  • программа для прорисовки химических формул.

Геномы:
  • геном бактерии Escherichia coli (Кишечная палочка);
  • геном синезеленой бактерии Synechococcus.
Остальное:
  • статистические приложения GNU_R и GNUplot;
  • графические редакторы GIMP и ImageMagick.

Как тут не радоваться? Такие возможности открываются перед исследованием и работой.
Не верите зайдите на сайт VigyaanCD.org и посмотрите сами.

Я потратил несколько дней, чтобы его скачать, и не остался в разочаровании. Этот Интсрумент пока что лучшее, что можно использовать бесплатно.

Комментариев нет: